在戰鎚Online中每一條戰線都擁有四個戰場層級，而每一個層級都擁有三到四個劇情戰役地圖，贏得劇情戰役的勝利將可以獲得該戰場層級的勝利點數，進而獲得戰場層級的控制權！要加入劇情戰役很簡單，只要選取小地圖旁的骷顱頭圖示就可以直接排隊加入該戰場層級當中的三個劇情戰役，每個劇情戰役的地形、戰況都不一樣，勝利的條件也略有不同，不過原則上每個劇情戰役所花費時間都在15分鐘，戰役結束之後會將玩家直接傳送回原來的位置。

在劇情戰役當中，過高等級的玩家無法參與較低層級的劇情戰役，而且等級較低的玩家會在劇情戰役當中暫時提高等級，玩家的血量、抗性也都會隨之提升到該有的水平，讓每一位玩家都可以為戰役獲勝貢獻自己的心力。

在劇情戰役中有多種增加戰役分數的方式，最常見的是攻佔地圖上的據點，當同陣營的成員站在據點附近時螢幕上會開始出現佔領據點的進度條，當我方成員越多，據點佔領的速度越快，但若雙方同時都有玩家在據點附近時則無法進行任何佔領動作，所以在進行佔領時必須先清除區域內所有敵軍，此外當攻佔敵方據點時，必須要先消除對方勢力再行佔領，因此將花上兩倍的時間。

在佔領據點的劇情戰役當中，無論是防守或是攻佔據點，都必須儘可能的待在據點範圍內，以防止敵軍搶攻。勝利的關鍵就在於快速的集結兵力在各個據點中出奇不意地轉換攻擊目標讓對方疲於奔命而無從防禦。

在部分劇情戰役當中，雙方陣營的玩家必須互相搶奪目標物，持有的一方將有固定的勝利點數進帳，但持有目標物的玩家將會不斷的損血而且時間越長失血的情況將越嚴重，因此給予持有目標物的戰友必要的支援並在適當的時機由換人接手都考驗著團隊彼此的默契，此時持有目標物的玩家將盡可能移動到友方陣營重生點的附近，較利於防守。

另一種戰役進行方式為設法將目標物帶到任務點，在速度上有優勢的職業角色可在戰場開始倒數前準備衝刺，防守方玩家必須盡力護送目標物持有者並阻止敵方的干擾，所有可以擊飛敵方、延遲敵方行動的技能都將在此發揮極大的功效，運用得當將在此戰役無往不利。